頭皮屑生成的原因主要就是頭皮細胞代謝異常，而造成頭皮細胞代謝異常則有以下 8 種情況，有些時候甚至是健康的警訊。
一、頭皮油脂過多
人體頭皮分佈的皮脂腺比臉部更多，分泌量更大。皮脂是頭皮屑良好的培養基，只要是頭髮不乾凈，油脂分泌過多，就成頭皮屑生成的最佳環境，亦是細菌與真菌生長的溫床。
二、頭皮新陳代謝過快
在正常情況下代謝的頭皮是透明的，並不會被看到，但如果是頭皮新代謝過快，或是細胞成熟過不完全時，就會使產生的角質堆積，而以頭皮死細胞維生的孢子菌大量繁殖，造成角質剝落，滿頭如雪花般的頭皮屑也就出來嚇人了。
三、壓力與內分泌失調
頭皮屑的產生也有可能受到人體體內荷爾蒙分泌變化的影響，例如青春期的女性在生理期前後，或是免疫力差的人，都可能會有頭皮屑的困擾。而精神處於緊張狀態、有感情困擾、用腦過度或睡眠不足，這些壓力的表現都可能會刺激皮脂分泌更多的油，進而造成頭皮屑。
四、罹患皮膚疾病
例如脂漏性皮膚炎、毛囊炎、濕疹、乾癬（牛皮癬）、接觸性皮膚炎與輪狀癬等病患，都會有頭皮屑的狀況，濕疹與乾癬所產生的頭皮屑，跟一般細小的頭皮屑不同，而是一大塊一大塊的。
五、染髮與燙髮
染髮與燙髮會造成頭皮損傷，極易導致角質脫落而形成大片的頭皮屑，稱之為損傷性頭皮屑。
六、過量食用刺激性食物
過量食用如辣椒、蔥、蒜等刺激性食物也可能導致頭皮屑增加，因為刺激性的食物正好容易促成頭皮角質脫落的糠秕孢子菌的旺盛生長，自然容易形成頭皮屑。
七、季節變換
在春秋換季時節，氣溫忽冷忽熱，會使得頭皮分泌不正常，造成頭皮屑增多。而在冬天時皮膚較乾、飽水度差，當皮膚愈乾，油脂分泌也就愈多，就愈易形成頭皮屑。
八、缺乏營養素
許多人出現頭皮屑是因為人體體內缺乏有美容維他命之稱的維生素B，與維持頭髮健康的維生素H所致。
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